Важнейшим компонентом в структуре деятельности организации образования является деятельность методической службы.Работая над созданием условий для повышения профессиональной квалификации и педагогического мастерства коллектива, методическая служба ДЮЦЭТ реализует свою деятельность по приоритетным направлениям:  

- учебно-методическая работа (деятельность методического совета, методических объединений по направлениям экология, туризм, краеведение, работа школы молодого специалиста);

-консультативно-методическая работа;

-инструктивно-массовая работа;

-информационно-методическая работа;

-научно-исследовательская и опытническая работа;

-повышение профессиональной квалификации педагогов.

Организуя свою деятельность, методическая служба ДЮЦЭТ руководствуется действующей государственной нормативно-правовой базой,  нормативно-правовыми документами, регламентирующими деятельность организаций дополнительного образования, Уставом ДЮЦЭТ и годовым планом работы.

Реализуя стандарт государственной услуги «Прием документов и зачисление в организации дополнительного образования для детей по предоставлению им дополнительного образования», методический отдел разработал и апробировал программы:

-«Непрерывное экологическое образование и воспитание школьников в системе дополнительного образования на 2007-2010 гг»;

-«Компетентностный подход как средство профессионального самоопределения учащихся в ДЮЦЭТ на 2011-2015 гг»;

- «Создание единого образовательного промстранства для успешной социализации личности учащихся через сетевое взаимодействие на 2016-2018 гг».